Rotunda powstała w XIX wieku i była jednym z elementów systemu obronnego Zamościa. Podczas II wojny światowej (1940-1944) pełniła rolę więzienia gestapo i miejsca kaźni. Na dziedzińcu palono zwłoki. Trudno jest dokładnie określić liczbę ofiar. Przyjmuje się, że zginęło tu ok. 8 tysięcy osób. Obecnie w poszczególnych celach znajdują się pomniki poświęcone pamięci zamordowanym: żołnierzom, cywilom, harcerzom, więźniom Majdanka i Oświęcimia, pomordowanym przez Ukraińców, nauczycielom, pocztowcom i dzieciom Zamojszczyzny. W parku, w pobliżu murów Rotundy znajdują się groby partyzantów, żołnierzy polskich, radzieckich, ludności żydowskiej. Większość mogił to groby zbiorowe i bezimienne.