Kościół św. Mikołaja jest jednym z najstarszych w Gdańsku (XII w.). Dawniej służył miejscowej ludności i przybywającym ze świata kupcom i żeglarzom. W 1227 r. książę pomorski Świętopełk przekazał świątynię braciom Dominikanom.
Wraz z rozwojem miasta, zaistniała potrzeba wybudowania nowego kościoła. Różne były jego losy: w XVI w. należał do protestantów, był wielokrotnie zniszczony, ograbiony, ale jako jedyny ocalał w 1945 r. Podobno ze względu na postać św. Mikołaja, otaczanego przez prawosławnych Rosjan szczególną czcią,
Do zachowanych zabytków we wnętrzu należą: późnorenesansowy ołtarz z obrazem św. Mikołaja, Chrzest Jezusa, Madonna z Dzieciątkiem, Grupa Ukrzyżowania, drewniana płaskorzeźba Opłakiwanie, świecznik z podwójną figurą matki Bożej, gotyckie stalle, XVIII-wieczny prospekt organowy.